北京兒童醫院擁有教育部兒科學國家重點學科和教學團隊，是首都醫科大學兒科醫學院和兒科學系所在地，現有教授、副教授116人，承擔著本科及博士、碩士研究生、七年制兒科專業，護理大專及繼續醫學教育等多層次教學任務，并設有博士后流動站，每年為社會輸送大量兒科人才。
年來，為方便患者就醫，北京兒童醫院始終堅持24小時接診。醫院積極踐行公立醫院改革，推進預約掛號工作，優化服務流程，改善患者就醫體驗，受到國家衛生健康委的肯定和廣大群眾的認可。醫院還承擔了上級部門委派的重大兒童傳染病防治、抗震救災支援、突發公共衛生事件救治等醫療任務。
隨著我國人民生活水平的提高，家長對孩子身高的關注度越來越高。矮小的診斷標準：身高低于同地區、同種族、同性別、同年齡身材正常兒童身高平均值兩個標準差，或者身高低于該人群兒童身高的第3百分位。導致身材矮小的原因眾多，生長缺乏癥、家族性矮小、體制性青春期延遲、先天性卵巢發育不全、甲狀腺功能減低、性早熟所致的矮小、早產兒、小于胎齡兒、嚴重的佝僂病和骨骼發育畸形以及多種慢性疾病所致的矮小、特殊矮小綜合征等均可引起矮小。另外，特發性的矮小不僅與遺傳因素有關，也與不健康的生活方式密切相關。
內分泌科是醫院中一個專門內分泌科疾病的地方，主要負責糖尿病、肥胖癥、骨質疏松、痛風、脂質代謝紊亂以及甲狀腺、垂體、腎上腺、性腺、甲狀旁腺等疾病的臨床診治。
