北京兒童醫院共有在職職工3210人，其中醫生968人，護士1325人，醫技462人。正高級職稱292人，副高級職稱380人，中級職稱692人。醫院擁有中國現代兒科學奠基人諸福棠、中國兒童血液腫瘤學開創者胡亞美、中國小兒外科創始人之一張金哲等國內兒科界僅有的三位院士，以及突出貢獻專家、享受政府特殊津貼人員、新世紀百千萬人才工程人選、國家杰出青年科學基金獲得者等眾多高層次人才。

北京兒童醫院擁有教育部兒科學國家重點學科和教學團隊，是首都醫科大學兒科醫學院和兒科學系所在地，現有教授、副教授116人，承擔著本科及博士、碩士研究生、七年制兒科專業，護理大專及繼續醫學教育等多層次教學任務，并設有博士后流動站，每年為社會輸送大量兒科人才。

兒童期肥胖帶來的后果不可小視。較多見的并發癥如代謝綜合征、糖尿病、高血壓、高血脂、脂肪肝、痛風、睡眠障礙大血管和微血管疾病以及癌癥等。因此，積極篩查肥胖的病因及相關并發癥并進行有針對性的至關重要。

內分泌科是醫院中一個專門內分泌科疾病的地方，主要負責糖尿病、肥胖癥、骨質疏松、痛風、脂質代謝紊亂以及甲狀腺、垂體、腎上腺、性腺、甲狀旁腺等疾病的臨床診治。