醫(yī)院技術力量雄厚。擁有重點學科兒科學，國家兒童腫瘤監(jiān)測中心、國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學研究中心、國家中西醫(yī)協(xié)同旗艦醫(yī)院試點單位等12個平臺，8個國家臨床重點?？疲?個北京市重點實驗室，2個北京市級研究平臺以及16個市級醫(yī)療中心。醫(yī)院設有疑難罕見病例會診中心和遠程會診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內地位，是中華醫(yī)學會兒科學分會、兒外科分會，中國醫(yī)師協(xié)會小兒外科醫(yī)師分會，中華護理學會兒科專業(yè)委員會主任委員單位。

耳鼻咽喉頭頸外科學科帶頭人倪鑫，國家兒童醫(yī)學中心主任，首都醫(yī)科大學附屬北京兒童醫(yī)院院長，主任醫(yī)師，教授，博士生導師。

耳鼻咽喉頭頸外科教授團隊:倪鑫、鄭軍、葛文彤、張杰、劉海紅、許志飛、郭永麗、王生才等。

首都醫(yī)科大學附屬北京兒童醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科于1975年建科，2023年4月獲批國家重點臨床?？?，成立至今已經有近50年歷史。科室面向全國兒童患者，以診治耳鼻咽喉及頭頸部常見病和疑難危重疾病為主，是中華醫(yī)學會耳鼻咽喉頭頸外科分會小兒學組組長單位和中國醫(yī)師協(xié)會耳鼻咽喉頭頸外科分會小兒學組組長單位?，F下設四個臨床專業(yè)和三大臨床診療中心，即耳科專業(yè)、鼻科專業(yè)、咽喉專業(yè)和頭頸專業(yè)以及兒童睡眠中心、兒童聽力診療中心和人工耳蝸中心。依托國家兒童醫(yī)學中心發(fā)展平臺，聯合首都醫(yī)科大學兒童上氣道阻塞性疾病臨床診療與研究中心、兒童耳鼻咽喉頭頸外科疾病北京市重點實驗室兩大科研支撐平臺，進行臨床-科研-教學三位一體的學科建設，目前已基本建成國內、國際先進的兒童耳鼻咽喉頭頸疾病綜合性基礎和臨床研究平臺。

科室現擁有醫(yī)療床位34張，睡眠中心床位12張，年門診量約20萬人次，年手術量3500余例。科室共有醫(yī)師46人、研究員2人、副研究員1人及技術人員18人。醫(yī)師中主任醫(yī)師18人，副主任醫(yī)師12人，主治醫(yī)師9人，住院醫(yī)師7人?？剖椰F有教授5人，副教授2人，講師9人;博士研究生導師6人，碩士研究生導師1人。

科室擁有多種國內外的耳鼻咽喉頭頸外科醫(yī)療設備，如達芬奇機器人操作系統(tǒng)，美敦力顱神經電生理監(jiān)測系統(tǒng)，美敦力ENT電磁導航系統(tǒng)，超聲刀系統(tǒng)，蔡司顯微鏡，STORZ超高清鼻內鏡系統(tǒng)等，可充分滿足對兒童耳鼻咽喉頭頸外科所有病種的臨床診療需求。

北京兒童醫(yī)院眼科為擁有專業(yè)門診、病房、醫(yī)技檢查、驗光配鏡中心、弱視訓練、視感知覺工作室為一體的綜合性兒童眼病診療中心，同時為北京市殘聯指定殘疾評估、康復中心，并托管北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院、北京市順義區(qū)婦幼保健院、北京兒童醫(yī)院鄭州醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院新疆醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院黑龍江醫(yī)院。

目前眼科設有斜弱視、神經眼科、角膜病、眼整形、淚道病、青光眼、白內障、眼底病、眼腫瘤等專業(yè)。北京兒童醫(yī)院及托管醫(yī)院眼科共有病床49張，年均手術量5700余例，其中內眼手術約1300例，每年接診來自全國各地的眼病患兒約27.8萬人次。在小兒斜弱視、近視、淚道疾病、眼整形、兒童角膜移植、眼腫瘤、眼底病篩查及、視神經疾病、遺傳性眼病、青光眼白內障診治、微創(chuàng)玻璃體切割手術及角膜塑形鏡、兒童RGP鏡片及特種眼鏡驗配等方面積累了豐富的經驗。