主要研究方向為兒童糖尿病領域，涵蓋兒童糖尿病流行病學研究、生存、代謝控制狀況及胰島素抵抗相關疾病范化研究。先天性高胰島素性/新生兒糖尿病臨床與遺傳學研究。性腺研究主要包括嬰幼兒乳房發育臨床監測、DSD病因學及Kallmann綜合征的基因學研究、小陰莖的、AAA綜合征的遺傳學研究、DSD患者體格發育研究、Silver Russule 綜合征遺傳學研究等。同時承擔研究生教學以及留學生英文教學。
鞏純秀，首都醫科大學附屬北京兒童醫院，內分泌遺傳代謝科，主任醫師，博士，教授，博導。臨床擅長糖脂代謝疾病（兒童1型糖尿病、2型糖尿病、肥胖、低血糖、高血壓、特殊類型糖尿病）生長及骨代謝（身材矮小、佝僂病、甲狀旁腺疾病、發育遲緩）性腺及腎上腺疾病（性早熟、DSD（性發育異常）等。
兒童內分泌科主要看的是兒童發育中分泌的問題和基礎代謝疾病方面的問題。如果兒童發育中分泌過多會導致巨人癥和肢端肥大癥，如果生長缺乏或嚴重分泌不足就會出現矮小，如果孩子的性分泌異常，可能會出現性早熟，這是兒童內分泌的常見疾病。如果是基礎代謝疾病有問題，如兒童糖尿病和甲狀腺疾病，這也是兒童內分泌科的常規診斷和。
多年來，為方便患者就醫，醫院始終堅持24小時接診。北京兒童醫院積極踐行公立醫院改革，推進預約掛號工作，優化服務流程，改善患者就醫體驗，受到國家衛生健康委的肯定和廣大群眾的認可。醫院還承擔了上級部門委派的重大兒童傳染病防治、抗震救災支援、突發公共衛生事件救治等醫療任務。
